日向流云离开了，走的时候没有带走一个人，他问过夕颜，但是她说这里是她的家，日向流云将含光剑送给她。
在小姑娘含泪，猿飞日斩复杂，木叶忍者畏惧的目光中离开了。
他去了岩忍战场找到了卡卡西，为他移植了一只特殊的三勾玉写轮眼。
他去了雾隐战场，找到了宇智波富岳，但是说了什么没人知道，只是宇智波富岳并没有追究卡卡西这个非宇智波族人拥有写轮眼的事情。
那一天日向日足追上了日向流云，但是他身受重伤，从此以后将日向流云逐出日向一族。
而作为老师的波风水门很伤心，到了最后日向流云都没有去见他，从来都是满脸微笑的他将自己关在房间中两天没有出门。
日向流云被木叶村定位s级叛忍，没有下达追杀命令。
同样他离开木叶的消息传遍整个忍界，同时他的战绩同样传遍忍界，四代雷影暴怒，因为在日向流云身边出现了他老爹的尸体。
三代土影大野木松口气，这样的强者留在木叶是他非常忌惮的。
砂忍村新任四代风影的罗砂，简直高兴的手舞足蹈，和日向流云为敌是他一辈子的噩梦。
雾隐村得到这个消息，剩下的忍刀六人众重新带领雾隐忍者入侵火之国。
日向流云离开木叶对于其他忍村来说，这是好事，但是对于木叶来说，却是失去了最重要的战力，想要弥补这些战力不知道要死多少人。
引发了很多人对于木叶高层的不满，甚至有人又将白牙的事情拿出来说事，说木叶高层容不得强大的忍者崛起。
猿飞日斩为了这些事情本来因为柱间细胞而年轻一些的身体，正在以极快的速度老去，那都是愁的。
自来也本是准备到雾隐战场寻找日向流云的行动也泡汤了，让他恨不得将团藏再次拉起来鞭尸。
战争就这样继续开打，似乎一切都回到了原点。
迈特戴还是死了，已经身为上忍的他，看到太多的同伴死在忍刀七人众的手下，一怒之下开启八门遁甲之阵，将忍刀七人众踢死四个，剩下两个，枇杷十藏和西瓜山河豚鬼。
至于鬼灯满月先前就被日向流云的抓住，还在木叶监狱里呆着。
随着忍刀七人众死去，雾隐退出第三次忍界大战。
看到已经被削弱的木叶，岩隐和云隐也不再克制，新仇旧怨爆发又开始打起来，三国开始混战，直到各自精疲力竭才停下，但是那又是一年之后了。
这一年日向流云去了宇智波斑那里，和他学习不少东西，同时也是告诉一些宇智波斑不知道的秘密。
直到黑绝实在忍不住日向流云吐露的太多秘密只能无奈的和他接触，日向流云答应他，帮他救出大筒木辉夜姬，条件是他要配合自己。
黑绝答应了，但是他在心里并不新任日向流云，同样日向流云也不信任他，但是没办法日向流云现在拿他确实没什么办法。
与其让他躲着突袭暗算，还不如让他出现在明处，他的出现黑绝肯定会准备什么来克制他，但是谁在乎呢？当自己能够凝聚求道玉的那一天就是他的死期。
带土跟着宇智波斑学习，对于本来是自己准备好的棋子宇智波斑并没有什么保留的交给他很多东西，现在他已经不指望宇智波带土能为自己做多少事情了，他只是想等那一天他复活之后能够和大筒木一族的杂碎们好好打一架。
他相信日向流云，因为日向流云知道的很多事情都是他身上发生的，仿佛他能够先知先觉，而且他说的事情合情合理，甚至日向流云已经将什么是真正的月之眼计划告诉了他。
对于自己受到欺骗他很愤怒，同时也自嘲，为了所谓虚无缥缈的和平牺牲了一切，就连好基友千手柱间都是因为他而死。
直到他听到日向流云保证到时候一定同时复活他和千手柱间，他才在满足的笑容中死去。
就在宇智波斑死去的第二天，日向流云突然感觉到一阵来自月亮上的呼唤，同时他的双眼也躁动不已，这一刻他知道月亮上的那一支族人，制造出了那颗巨型转生眼。
但是日向流云也只能望洋兴叹，现在他是不敢去月亮上的，因为那一支族人现在按时间来说还有很多。
原著中，他们的分家和宗家的战斗应该是在大筒木舍人三四岁的时候，而大筒木舍人的年龄应该和鸣人差不多，所以还有很多时间要等，不然去了就是送死，因为那一族是可以使用巨型转生眼的。
那种威力日向流云不想试试自己能不能扛得住，所以他要等，等他们自相残杀结束，到时候他就领着整个晓组织冲上去夺走那颗巨型转生眼。
他感觉自己的白眼想要进化成转生眼恐怕契机还要在那颗巨型转生眼上。
所以现在开始布局晓组织才是王道，现在这个时间长门，弥彦，小南好像还在雨之国振兴晓组织吧！
这时的他们还是充满着梦想的白痴吧！看来需要自己这个教父来让他们感受一下什么是痛苦，没有痛苦的经历，想要成长实在太难。
但是过度的痛苦却会让人变成最可怕的野兽，就像原著中的长门。
所以日向流云现在考虑的是如何在弥彦还活着的时候让他们三个相信自己，而且怎么才能让长门开启轮回眼的能力，至于杀了弥彦还是算了，早晚把他们弄到自己对面去，那个自己的利息不符合。
思索良久还是觉得要让长门感受一下失去弥彦的绝望才行，但是不想让弥彦死，还要让长门绝望，看来还要好好谋划。